Списак делова радње Нарута

Cela priča serijala Naruto je podeljena na određene delove radnje (arkove). Svi delovi su poređani hronološkim redom, osim Kakašijeve hronike (eng. Kakashi Gaiden, прића о Какашијевом животу и његовом раном детињству).

Наруто

1. Уводни део (епизоде 1-5, поглавље 1-8): Овај део се усредсређује на представљање Нарута, Саскеа, Сакуре и Какашија, при чему се оснива Тим 7.
2. Земља Таласа (епизоде 6-19, поглавље 9-33): У овом делу Тим 7 добија задатак да штити градитеља мостова, Тазуну, на његовом повратку кући у Земљу таласа, како би изградио мост који ће да их повеже са копном и спаси од моћног трговца, Гата. Ту се Тим 7, заједно са Какашијем, суочава са опасним џонином, Забузом. У тој борби Какаши побеђује. Међутим, Тим 7 касније сазнаје да је Забуза још жив и припремају се за следећу битку на мосту. Следећег дана се Тим 7 налази са Забузом на мосту. Међутим, они упознају новог противника, Хакуа, који је спасио Забузу од Какашија. Након тешке борбе, Тим 7 поново побеђује и мост коначно може да буде завршен, под именом, Велики Наруто мост.
3. Чунин испит (епизоде 20-67, поглавље 34-114): У овом делу се Тим 7 пријављује на чунин испит. Такође се појављују неки ликови као што су Легендарни санини (Џираја, Цунаде и Орочимару), Кабуто Јакуши, Тим Гај, Гара и девет почетника (Нарутови стари пријатељи из разреда). У овом поглављу Орочимару ставља Знак клетве на Саскеа, који му даје невероватну моћ. Такође, Наруто касније добија новог тренера, Џирају, који ће га научити новој тенхици, док Саскеа тренира Какаши. У међувремену, Орочимару склапа уговор са Селом песка, и смишља план за уништење Конохе (Села сакривеног у лишћу).
4. Напад на Коноху (епизоде 68-80, поглавље 115-138): У овом делу Орочимару започиње свој план за уништење Конохе. Орочимару започиње борбу са трећим Хокагеом. У међувремену, Саске је у потери за тимом из Села песка. Наруто, Сакура, Шикамару и Какашијев пас Пакун су такође у потери за Саскеом и за тимом из Села песка. Касније, у Саскеовој борби са Гаром, Наруто му спашава живот и улази у борбу са Гаром. У међувремену, трећи Хокаге користи забрањену технику како би зауставио Орочимаруа и на крају успева да му одузме нинџуцу, тј. његове руке и у тој борби умире. Наруто је успео поразити Гару захваљујући Гамабунти (жапцу мудрацу).
5. Итачјев повратак (епизоде 81-85, поглавље 139-148): У овом делу се појављује Итачи, Саскеов брат, заједно са својим партнером, Кисамеом, над којим је желео освету због масакра његовог клана. Ту се сазнаје нешто више о групи Акацуки, о њиховим плановима, и о томе како желе да ухвате Нарута, како би из њега извукли моћ Деветорепе лисице.
6. Потрага за Цунаде (епизоде 86-100, поглавље 149-171): У овом делу Наруто и Џираја покушавају пронаћи Цунаде како би је вратили у село и именовали за петог Хокагеа. Али ипак, и Орочимару и Кабуто су потрази за Цунаде, како би излечила Орочимаруове руке. Орочимару јој нуди да јој врати браћу у замену за то. Али, она одбија и ту настаје сукоб, којем се придружују Наруто и Џираја. Три санина се сукобљавају, Џираја и Цунаде против Орочимаруа. Они успевају да га победе али он успева некако да се извуче и да побегне. Цунаде се касније враћа у село и постаје пети Хокаге.
7. Разоткривање Какашијевог лица (епизода 101 - посебни аниме додатак): У овом делу Тим 7 покушава скинути Какашијеву маску и разоткрити његово право лице..
8. Земља чаја (епизоде 102-106, посебни аниме додатак): У овом делу Тим 7 помаже Ибикијевом брату Идатеу да заврши трку. Ту се сукобљавају са Аоијем, нинџом из Села кише. По завршетку мисије, Саскеу буде криво због Нарутових дотадашњих успеха.
9. Саскеово спашавање (епизоде 107-135, поглавље 172-238): У овом делу, Саске, понижен због Нарутових подухвата, бори се са Нарутом и након тога бежи из Конохе и иде код Орочимаруа како би постао моћнији и осветио свој клан. Некон његовог одласка, Цунаде формира тим који ће вратити Саскеа. Тим се састоји од Шикамаруа (чунин вође), Нарута, Неџија, Кибе и Акамаруа и Чоџија (касније и Рок Лија и Тима из Села песак). Они се у току потере раздвајау и боре се појединачно са Орочимаруовим нинџама. Касније им долазе у помоћ и Рок Ли и Тим из Села песка. На крају се Наруто сукобљава са Саскеом поново, али овога пута у жестокој бици. Ту се сазнаје много тога о Учиха клану, као и о пореклу Мангекјо Шарингана. На крају борбе Наруто губи и сви се враћају у Коноху. У међувремену, Акацуки почиње да планира свој потез и тиме се завршава први део Наруто манга серијала.

Филери

Филери су додатне епизоде које прати само аниме, како би дозволио да манга има предност и да произведе више садржаја. Оне су слабо повезане са главном радњом. Филери обухватају епизоду 26 (када Конохамару и његов тим интервјуишу Тим 7 пре почетка другог дела чунини испита), епизоде 102-106 (мисија у Земљи чаја) и епизоде 136-220 (само половина 220-те епизоде је филер).

1. Земља пиринчаних поља (епизоде 136-141): У овом делу Наруто, Сакура и Џираја иду на С-ранк мисију проналаска Орочимаруовог скровишта у нади да ће тамо пронаћи Саскеа. Џираја их одводи у Земљу пиринчаних поља, где се налази Село звука. Ту се сукобљавају са неким члановима клана Фума и упознају девојку по имену Сасаме која им се придружује како би пронашла свог рођака Арашија којег је такође заробио Орочимару. Она их касније издаје, и ставља им отров у чај. Они схватају да она то ради због свог рођака и опраштају јој. Они настављају потрагу (остављајући Сасаме код дрвета) и на крају стижу до Орочимаруовог скровишта. Ту се раздвајају (Наруто и Сакура иду заједно, док Џираја иде одвојено) и наилазе на многе препреке. Сакура наилази на члана Фума клана који је прерушен у Кабута и бори се са њим уплашена, али јој Наруто прискаче у помоћ и замало да буде поражен. Касније долази Араши прерушен у Орочимаруа и они се боре са њим. Џираја им касније прискаче у помоћ и спашава ситуацију. На крају Сакура схвата да мора више да се потруди и тражи од Цунаде да она буде њена ученица и да је Цунаде учи медицинским вештинама како била од користи у свом тиму током мисија.
2. Мизуки узвраћа ударац (епизоде 142-147): У овом делу Мизуки, крималац од раније (који је покушао да украде забрањени свитак), се враћа и овога пута много јачи. Такође је ослободио још два криминалца, Фуџин и Рајџин. Они су се борили са Нарутом и Ируком а касније су у помоћ притекли Шикамару, Ино и Чоџи. У овом делу се сазнаје да је Мизукијева крађа свитка била заправо Орочимаруов задатак. Цунаде долази у помоћ Ино-Шика-Чо триу. Мизуки узима тајну формулу која га претвара у тигра. Његова жена Цубаки покушава да га одврати од Орочимаруа, али безуспешно. Наруто и Ирука коначно успевају стићи до Мизукија и поразити га. Касније га враћају у затвор заједно са Фуџином и Рајџином.
3. Потрага за Бикочуом (епизоде 148-151): У овом делу Наруто, заједно са Тимом 8 (Шино, Киба и Хината) тј. Тимом Куренај, иде у мисију у потрази за ретком бубом Бикочу која би уз помоћ мириса пронашла Саскеа. Када стигну сазнају да је још неко у потрази за Бикочуом, три члана из клана Камизуру, Џибачи, Куробачи и Сузумебачи. Обе стране се жестоко боре да пронађу Бикочу. У почетку заробљавају Хинату, и траже Бикочу у замену за њу. Шино их покушава преварити и даје им другу бубу која је само прерушена у Бикочу, али бивају разоткривени и заробљени. Хината се сама ослобађа и на крају узимају Бикочу. Нажалост, Наруто је натерао Бикочу да прати његов гас уместо Саскеа.