Ramnogalakturonanska eksolijaza
| Ramnogalakturonanska eksolijaza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||
| EC broj | 4.2.2.24 | ||||||||
| Baze podataka | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pregled | ||||||||
| BRENDA | BRENDA pristup | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme pregled | ||||||||
| KEGG | KEGG pristup | ||||||||
| MetaCyc | metabolički put | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| Strukture PBP | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum | ||||||||
| |||||||||
Ramnogalakturonanska eksolijaza (EC 4.2.2.24, YesX) je enzim sa sistematskim imenom alfa-L-ramnopiranozil-(1->4)-alfa-D-galaktopiranoziluronat eksolijaza.[1][2] Ovaj enzim katalizuje sledeću hemijsku reakciju
- Eksotipno eliminativno razlaganje alfa-L-ramnopiranozil-(1->4)-alfa-D-galaktopiranoziluronsko kiselinskih veza ramnogalakturonan I oligosaharida koji sadrže alfa-L-ramnopiranozu na redukujućem kraju i 4-dezoksi-4,5-nezasićenu D-galaktopiranoziluronsku kiselinu na neredukujućem kraju. Produkti su disaharid 2-O-(4-dezoksi-beta-L-treo-heks-4-enopiranuronozil)-alfa-L-ramnopiranoza i skraćeni ramnogalakturonanski oligosaharid koji sadrži 4-dezoksi-4,5-nezasićenu D-galaktopiranoziluronsku kiselinu na neredukujućem kraju.
Ovaj enzim učestvuje u degradaciji ramnogalakturonana I kod Bacillus subtilis vrste 168.
Reference
[уреди | уреди извор]- ^ Ochiai, A., Itoh, T., Mikami, B., Hashimoto, W. and Murata, K. (2009). „Structural determinants responsible for substrate recognition and mode of action in family 11 polysaccharide lyases”. J. Biol. Chem. 284: 10181—10189. PMID 19193638.
- ^ Ochiai, A., Itoh, T., Kawamata, A., Hashimoto, W. and Murata, K. (2007). „Plant cell wall degradation by saprophytic Bacillus subtilis strains: gene clusters responsible for rhamnogalacturonan depolymerization”. Appl. Environ. Microbiol. 73: 3803—3813. PMID 17449691.
Literatura
[уреди | уреди извор]- Nicholas C. Price; Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third изд.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X.
- Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 изд.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036.
- Branden C; Tooze J. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN 0-8153-2305-0.
- Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 изд.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097.
Spoljašnje veze
[уреди | уреди извор]- Rhamnogalacturonan+exolyase на US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
