Domen inhibitora apoptoze
| Domen inhibitora apoptoze | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 NMR rešenje strukture BIR domena ljudskog BIRC2 proteina.[1] N-terminus = plavo, C-terminus = crveno, dok je cink prikazan sivim sferama. | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
| Simbol | BIR | ||||||||
| Pfam | PF00653 | ||||||||
| InterPro | IPR001370 | ||||||||
| PROSITE | PS50143 | ||||||||
| SCOP | 1qbh | ||||||||
| SUPERFAMILY | 1qbh | ||||||||
| |||||||||
Domen inhibitora apoptoze (IAP ponavljanje, Bakulovirusni inhibitor apoptoznog proteinskog ponavljanja, BIR) je strukturni motiv prisutan u proteinima koji učestvuju u apoptozi, citokinskoj produkciji, i segregaciji hromozoma.[2] Proteini koji sadrže BIR su poznati kao inhibitori apoptoze (IAP), kao i BIRP ili BIRC (engl. BIR-containing proteins). U te proteine se ubrajaju BIRC1 (NAIP), BIRC2 (cIAP1), BIRC3 (cIAP2), BIRC4 (xIAP), BIRC5 (survivin) i BIRC6.[2][3]
BIR domeni pripadaju familiji domena cinkovog prsta i karakteristično imaju brojne nepromenljive aminokiselinske ostatke, uključujući tri konzervirana cisteina je jedan konzervirani histidin, sa koordinatno vezanim jonom cinka.[4] Oni se tipično sastoje od 4-5 alfa heliksa i trolančane beta ravni.
Reference
[уреди | уреди извор]- ^ PDB: 1QBH;Hinds MG, Norton RS, Vaux DL, Day CL (1999). „Solution structure of a baculoviral inhibitor of apoptosis (IAP) repeat”. Nat. Struct. Biol. 6 (7): 648—51. PMID 10404221. doi:10.1038/10701.
- ^ а б Silke J, Vaux DL (2001). „Two kinds of BIR-containing protein - inhibitors of apoptosis, or required for mitosis”. J. Cell. Sci. 114 (Pt 10): 1821—7. PMID 11329368.
- ^ Verhagen AM, Coulson EJ, Vaux DL (2001). „Inhibitor of apoptosis proteins and their relatives: IAPs and other BIRPs”. Genome Biol. 2 (7): REVIEWS3009. PMC 139420
. PMID 11516343. doi:10.1186/gb-2001-2-7-reviews3009.
- ^ Birnbaum MJ, Clem RJ, Miller LK (1994). „An apoptosis-inhibiting gene from a nuclear polyhedrosis virus encoding a polypeptide with Cys/His sequence motifs”. J. Virol. 68 (4): 2521—8. PMC 236730 . PMID 8139034.
Spoljašnje veze
[уреди | уреди извор]- Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_II_1
- Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_III_1
- Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_III_2
- Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_III_3
- Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG_BIR_III_4
Ovaj artikal sadrži tekst iz javnog vlasništva Pfam i InterPro IPR001370